Дальнейшее понимание генетического разнообразия и эволюции вирусов гриппа А, циркулирующих у свиней (IAV - S) имеет важное значение для разработки эффективных вакцин и наших познаний о пандемии угроз. До недавнего времени очень мало было известно о разнообразии вируса свиного гриппа А в Латинской Америке в связи с отсутствием обзорных наблюдений.
Для устранения этого пробела мы секвенировали и провели филогенетический анализ 69 последовательностей гемагглютинина из изолятов вируса свиного гриппа А, собранных у свиней в Мексике и Чили в 2010 - 2014 гг., включая следующие подтипы: H1N1, H1N2 и H3N2.
Наш анализ определил множественные клеточные линии вируса свиного гриппа А, которые, как выясняется, циркулировали среди свиней незамеченными в течение десятилетий, включая четыре новые клеточные линии вируса свиного гриппа А, имеющие происхождение от сезонного вируса человека, которые на глобальном уровне не определялись ни у одного поголовья свиней. Мы также нашли доказательства повторных передач вирусов пандемического гриппа H1N1 от человека к свиньям в Мексике и Чили с 2009 года, и нашествие вирусов H1 и H3 от свиней Северной Америки в Мексику.
В целом, результаты наших исследований показывают, что, по крайней мере, 12 генетически различных клеточных линий, содержащих гемагглютинин вируса гриппа, циркулируют в латиноамериканских стадах свиней, из которых только два были найдены в североамериканских стадах свиней. Передача от человека к свинье, пространственная миграция посредством передвижения свиней и геномная рекомбинация являются теми ключевыми механизмами, которые генерируют это вирусное разнообразие. Дополнительное определение антигенных характеристик и секвенирование всего генома очень нужны, чтобы понять разнообразие и независимую эволюцию вируса свиного гриппа А в Латинской Америке.
Nelson M, Culhane MR, Rovira A, Torremorell M, Guerrero P, Norambuena J; Novel Human-like Influenza A Viruses Circulate in Swine in Mexico and Chile; PLoS Curr. 2015 Aug 13;7. pii: ecurrents.outbreaks.c8b3207c9bad98474eca3013fa933ca6. doi: 10.1371/currents.outbreaks.c8b3207c9bad98474eca3013fa933ca6.