0
Вирусы с одноцепочечной кольцевой ДНК могут поражать широкий круг хозяев, таких как шимпанзе, крупный рогатый скот, летучих мышей, свиней и так далее, и могут также передаваться человеку напрямую или опосредованно. Даже при том, что у них общие характеристики с точки зрения организации генома или структур, их геномная последовательность имеет тенденцию быть переменной, показывая различные филогенетические образцы. Недавно, в Корее был изолирован новый ассоциированный вирус с одноцепочечной кольцевой ДНК в стуле крупного рогатого скота. Позже, были обнаружены ассоциированныt вирусs с одноцепочечной кольцевой ДНК в стуле свиней PigSCV и PoSCV в Германии и Новой Зеландии соответственно. Поэтому, предполагалось, что новый вирус с одноцепочечной кольцевой ДНК можно идентифицировать из свиных экскрементов в Корее. Так, впервые, большое количество фекальных образцов свиней, взятых из корейских ферм, проверялись на наличие PoSCV в течение шестимесячного периода с июля 2012 до декабря 2012.
Всего 233 образца кала свиней с диареей было собрано с июля 2012 до декабря 2012. Они изменялись согласно возрасту, времени или региону. Проводилось извлечение ДНК из этих образцов. Образцы ДНК были проанализированы с помощью метода гнездовой ПЦР.
Результаты указали на присутствие нуклеиновой кислоты PoSCV в свиных фекальных образцах. Полный процент обнаружения составил приблизительно 62% (144/233). Никаких существенных различий в распространенности PoSCV не было найдено среди возрастных групп и регионов. Однако процент обнаружений в ноябре и декабре приблизительно в 2 раза ниже, чем в июле и августе.
Процент обнаружений PoSCV в свиных образцах кала в Корее за шесть месяцев исследования составил приблизительно 60%. Впервые в Корее было замечено, что вирус может распространяться в свиных фермах. Результаты показали, что ни возраст, ни регион обитания свиней не сильно влияли на показатели появления PoSCV, хотя время года может. Кроме того, метод гнездовой ПЦР можно было бы рассматривать как надежный метод для идентификации PoSCV, улучшая чувствительность. Предложено дальнейшее исследование по полной последовательности положительных образцов, и различие в последовательности этих штаммов и штаммов, обнаруженных в мировом масштабе, было бы проанализировано филогенетическим образом.
Hee C. Chung, A R. Kim, Eun O. Kim, Hye K. Kim, Van G. Nguyen, Min K. Choi, Hye J. Yang, Jung A. Kim, Bong K. Park. The 6th Asian Pig Veterinary Society Congress. 2013. OR52