Согласно филогенетическим данным вирус классической чумы свиней (ВКЧС) образован двумя кладами. Для защиты животных от ВКЧС широко применялась такая ослабленная живая вакцина как HCLV. Однако влияние вакцинации на развитие ВКЧС не изучалось.
Мы провели системный анализ влияния вакцинации на эволюцию ВКЧС, сравнив данные по вакцинированным и невакцинированным против ВКЧС группам. Было обнаружено, что вакцинация может оказывать влияние на многообразие штаммов и процесс ускользания вируса от иммунного ответа посредством рекомбинации и точечной мутации. Также было выяснено, что вакцинация может влиять на динамику популяции, скорость эволюции вируса классической чумы свиней, а также на процесс его адаптивной эволюции. Полученные нами фактические данные предполагают, что вакцинация также может изменять процесс адаптации носителя, влияя на частоту использования кодона вирусом в организме животного. Согласно данным исследования, необходимо избегать чрезмерного применения ослабленных вакцин против ВКЧС.
Ji W, Niu DD, Si HL, Ding NZ, He CQ. Vaccination influences the evolution of classical swine fever virus. Infect Genet Evol. 2014 Apr 18;25C:69-77. doi: 10.1016/j.meegid.2014.04.008.