Для определения и характеристики этиологического агента(ов), связанного с вспышкой сильной диареи у поросят в провинции Цзянси, Китай, в марте 2015 была разработана гнездовая полимеразная цепная реакция с обратной транскриптазой (RT-PCR) для определения дельта коронавируса свиней (PDCoV).
Проведенное исследование основанное на гнездовой RT-PCR, определило, что моноинфекция дельта коронавируса свиней (33,71%) и коинфекция дельта коронавируса свиней (19,66%) с вирусом эпизоотической диареи свиней были распространены у диарейных свиней в Цзянси, Китай. В образцах диареи негативных на вирус ЭДС наблюдалось высокое распространение дельта коронавируса свиней (58.33%). Была определена полная последовательность генома репрезентативного штамма дельта коронавируса свиней PDCoV/CHJXNI2/2015. Филогенетический анализ полного генома и последовательность S протеина PDCoV/CHJXNI2/2015 демонстрируют, что он в большинстве своем близко связан с дельта коронавируса свиней из Гонконга и США.
Насколько нам известно, это первый отчет об идентификации, распространении, полном секвенировании генома и молекулярных характеристиках дельта коронавирус свиней в образцах диареи в Китае.
D. Song, et al. Вновь появившийся дельта коронавирус свиней ассоциированный с диареей : Идентификация, распространение и полное секвенирование генома. Трансграничные и появляющиеся болезни. Том 62, Выпуск 6, стр 575–580, декабрь 2015. DOI: 10.1111/tbed.12399