0
Вирусы генома Бокавируса ассоциируются с респираторными и кишечными заболеваниями у собак и крупного рогатого скота. Более того, за последние годы был идентифицирован новый свиной бокавирус у домашних и диких свиней, но точная дата неизвестна.
Главными задачами данного исследования стали определение уровня распространения и генетического разнообразия PBoV у свиней в США. При помощи недавно созданных многоканальных тестов методом ПЦР в масштабе реального времени, было исследовано 385 легких, лимфатических узлов, образцов сыворотки и кала у свиней с различной степенью заболевания. Идентифицировали высокий уровень распространения PBoV в пределах от 21.3-50.8% в исследуемых образцах, часто в одном и том же образце было выявлено два и более видов PBoV. Клонирование и последующий анализ частичного неструктурного белка NS1и капсидного белка VP1 и VP2 образцов ДНК положительных на группы PBoV (G) 1 (n=6), 2 (n=16) и 3 (n=42), включая подгруппы 3A, 3B или 3C, выявил высокое генетическое разнообразие в особенности гена PBoV G3 VP2, но в то же время ген PBoV G1 VP1 показал низкий нуклеотидный полиморфизм. При помощи «блуждающей затравки» было получено 18 неполных или почти полных геномов PBoV, и шесть из 18 почти полных геном представляли новые виды PBoV. Рекомбинационный анализ с использованием неполных NS1, VP1, VP2 генов и почти полных геном показал возможные явления рекомбинации внутри и между PBoV.
Для выявления возможной патогенной роли этих разнообразных PBoV необходимы будут дальнейшие исследования.
Yong-Hou Jiang, Chao-Ting Xiao, Shuang-Hui Yin, Priscilla Gerber, Patrick Halbur, and Tanja Opriessnig. High prevalence and genetic diversity of porcine bocaviruses (PBoV) in US pigs and identification of multiple novel PBoVs J Gen Virol vir.0.057042-0; published ahead of print November 16, 2013, doi:10.1099/vir.0.057042-0