X
XLinkedinWhatsAppTelegramTelegram
0
Читайте эту статью в:

Геномное секвенирование и анализ нового изолята вируса РРСС из Огайо: вирус продолжает меняться

Данное исследование подтверждает важность непрерывного  мониторинга эволюции вируса РРСС с использованием геномного секвенирования.

5 Октябрь 2015
X
XLinkedinWhatsAppTelegramTelegram
0

Изучение генных характеристик респираторно-репродуктивного синдрома свиней (РРСС) показало, что в данный момент в мире циркулируют два генотипа вируса-возбудителя – европейский (тип 1) и североамериканский (тип 2). Вирус РРСС содержит 15-килобитный геном, кодирующий структурные белки в 3-футовом отрезке.

В 2013 г. в Диагностическую ветеринарную лабораторию при Департаменте сельского хозяйства Огайо с одной из ферм штата поступили шесть образцов крови свиней, страдающих тяжелыми респираторными заболеваниями. Методом ПЦР в реальном времени было установлено, что все они положительны на вирус РРСС. Значения, полученные с помощью компьютерной томографии (КТ), во всех образцах располагались в диапазоне от 15,85 до 28,38. Изоляция вируса проводилась с использованием клеточной линии MARC-145. Цитопатический эффект проявился на 4-й день после инокуляции. Было проведено полное геномное секвенирование всех образцов. Полный геномный анализ показал, что последовательности нуклеотидов данного штамма РРССВ (OH28372) соответствуют штаммам, информация о которых содержится в базе GenBank (включая XW001 и NADC30), на 92% и меньше. Нуклеотидное соответствие гена ORF5 штамма OH28372 другим последовательностям, информация о которых есть в GenBank составило 96%. Кроме того, OH28372 обладает делецией 13 нуклеотидов в 3-футовом нетранслируемом геноме. Как и геномный анализ, филогенетическое исследование полного генома показало, что OH28372 более близок к двум свежим штаммам (XW001 и NADC30) североамериканской линии.

Данное исследование подтверждает важность непрерывного  мониторинга эволюции вируса РРСС с использованием геномного секвенирования.

L. Wang, Y. Zhang. Геномное секвенирование и анализ нового изолята вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней из Огайо: вирус продолжает меняться. Североамериканский симпозиум по РРСС, 2014.

Комментарии к статье

Эта область не предназначена для консультаций авторов по поводу своих статей, это место для открытых дискуссий между пользователями pig333.ru
Оставьте новый Комментарий

Ограниченный доступ пользователям 333. Чтобы отправить комментарий, Вам необходимо авторизироваться

Вы не подписаны на этот список Последние новости в свиноводстве

Введите логин и зарегистрируйтесь на список

Вы не подписаны на этот список pig333.ru за 3 минуты

Каждые две недели обновляется рассылка новостей на всех сайтах pig333.ru

Введите логин и зарегистрируйтесь на список