Генетические и филогенетические анализы показывают, что пандемический вирус H1N1 / 2009 был получен из традиционной генетической линии свиного гриппа; однако, нет никаких убедительных доказательств того, что пандемический вирус был создан с прямого предшественника в свиньях. Кроме того, эволюционная динамика вируса гриппа у свиней не была хорошо зафиксирована документально.
Здесь мы сопоставили рекомбинантный вирус (rH1N1) с тем же компонентным составом, как и пандемический вирус H1N1 / 2009, с девятью последовательными пассажами на свиньях. Тяжесть инфекции последовательно увеличивается с каждым пассажем. Глубокое секвенирование вирусных квази - видов, начиная с девятого пассажа, обнаружило пять общих элементов аминокислотных мутаций: PB1 A469T, PA 1129T, NA N329D, NS1 N205K и NEP T48N. Мутации в белке гемагглютинина, однако, отличаются в значительной степени между верхними и нижними дыхательными путями. Были отобраны три репрезентативных вирусных клона с пятью общими элементами мутаций для определения функциональной оценки. По отношению к исходному вирусу три вирусных клона показали усиление репликации и полимеразной активности в лабораторных условиях, и усиление репликации, патогенность и заразность в живых организмах свиней, морских свинок и хорьков. В частности, два мутанта rH1N1 (PB1 A469T, и в сочетании с NS1 N205K и НЭП T48N) были определены в качестве факторов, определяющих заразность у морских свинок. Важно то, что один мутантный вирусный клон с пятью общими элементами мутаций, который также содержал мутации D187E, K211E и S289N в своём гемагглютинине (HA), был кроме всего прочего способен эффективно заражать хорьков воздушно-капельным путём, как пандемический вирус.

Результаты наших исследований показывают, что вирус гриппа может приобрести вирусные характеристики, аналогичные пандемическому вирусу после небольшого числа серийных пассажей на свиньях.
Значение
Мы показали здесь сконструированный химерный вирус свиного гриппа с тем же генным компонентным составом, что и у пандемичекого вируса H1N1/2009, подвергнувшийся лишь девяти серийным пассажам на свиньях, который приобрёл значительно повышенную вирулентность и заразность. В особенности, один представитель патогенных пассированных вирусных клонов, нёсший три мутации в гене гемагглютинина и пять общих элементов мутаций в генах PB1, PA, NA, NS1 и NEP, был дополнительно способен эффективно передаваться воздушно - капельным путём, как пандемический вирус H1N1/2009. Результаты наших исследований свидетельствуют, что свиньи могут легко вызвать адаптивные мутационные изменения в исходном вирусе пандемического характера, чтобы превратить его в очень опасную и инфекционную форму, близкую пандемическому вирусу H1N1 / 2009, подчёркивает непосредственную потенциальную роль свиней в стимулировании роста патогенности и заразности вируса гриппа А.
K Wei, H Sun, Z Sun, Y Sun, W Kong, J Pu, G Ma, Y Yin, H Yang, X Guo, RG Webster, K-C Chang and J Liu. Influenza A virus Acquires Enhanced Pathogenicity and Transmissibility After Serial Passages in Swine. J Virol. 2014 Aug 6. doi: 10.1128/JVI.01679-14