X
XLinkedinWhatsAppTelegramTelegram
0
Читайте эту статью в:

Рекомбинация вируса РРСС может способствовать образованию мозаичных изолятов

Анализ ОРС5 (ОРС - открытая рамка считывания) и полно размерной последовательности генома изолятов РРСС с генотипом 1 и 2, собранных со всего мира, подтверждает тот факт, что рекомбинация представляет собой распространенное явление, в результате которого могут образовываться мозаичные изоляты.

14 Май 2014
X
XLinkedinWhatsAppTelegramTelegram
0

Исследователи из Отделения здоровья и анатомии животных из Центра исследования здоровья животных (Автономный университет Барселоны, Беллатерра), Национального ветеринарного института (Технический университет Дании), Института Пирбрайт (Великобритания), а также из Центра исследований в области питания и развития (CIAD AC, Мексика) изучили полноразмерную последовательность генома с целью определения потенциальных точек рекомбинации на протяжении вирусного генома. Для ОРС5 были в отдельности проанализированы 11 наборов последовательностей в генотипе 1, собранных из различных географических мест, включая два азиатских, один американский и 7 европейских регионов, а также 3 набора генотипа 2, из таких стран, как Китай, Мексика и Соединенные штаты Америки.

Потенциальные точки рекомбинации были обнаружены в 10 из 11 наборов последовательностей генотипа 1, из которых в 9 случаях кластеризация по крайней мере одного изолята отличалась до и после рекомбинации. В генотипе 2 наличие потенциальных точек рекомбинации, а также образование различных кластеров с древовидной структурой у хотя бы одного штамма до и после точки рекомбинации наблюдалось в 2 из 3 наборов. Результаты показали, что большинство данных по ОРС5 содержало по крайней мере одну рекомбинантную последовательность. При анализе полноразмерных последовательностей генома в наборах последовательностей и с генотипом 1, и с генотипом 2 были обнаружены точки рекомбинации (10 и 9 соответственно), что привело к выделению довольно отличных друг от друга типологий до и после точек рекомбинации. Образование геномов с мозаичной структурой наблюдалось в последовательностях генотипа 1.

Вирус РРСС является одним из самых серьезных вирусов, влияющих на свиноводство по всему миру, вызывая огромные экономические потери и санитарные проблемы. Один из ключевых вопросов, связанных с вирусом РРСС, обусловлен генетическим многообразием вируса, что как представляется, непосредственно влияет на иммунобиологию, эпидемиологию, диагностику и эффективность вакцинации. Одной из причин такого генетического многообразия является рекомбинация между штаммами. Данное исследование подтверждает, что рекомбинантные изоляты вируса РРСС распространены в большинстве стран с высоким уровнем производства свинины, особенно вирус РРСС генотипа 1. Это наблюдение предполагает необходимость тщательного исследования характеристик штаммов вируса РРСС, последующего расширения филогенетических исследований, а также развитие новых стратегий контроля вируса РРСС. Кроме того, в рассматриваемой статье подчеркивается необходимость более глубокого осмысления механизмов и условий возникновения генетического многообразия вируса РРСС.

Martín-Valls GE, Kvisgaard LK, Tello M, Darwich L, Cortey M, Burgara-Estrella AJ, Hernández J, Larsen LE, Mateu E. Analysis of ORF5 and Full-Length Genome Sequences of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolates of Genotypes 1 and 2 Retrieved Worldwide Provides Evidence that Recombination Is a Common Phenomenon and May Produce Mosaic Isolates. J Virol. 2014 Mar;88(6):3170-81.

Комментарии к статье

Эта область не предназначена для консультаций авторов по поводу своих статей, это место для открытых дискуссий между пользователями pig333.ru
Оставьте новый Комментарий

Ограниченный доступ пользователям 333. Чтобы отправить комментарий, Вам необходимо авторизироваться

Вы не подписаны на этот список Последние новости в свиноводстве

Введите логин и зарегистрируйтесь на список

Вы не подписаны на этот список pig333.ru за 3 минуты

Каждые две недели обновляется рассылка новостей на всех сайтах pig333.ru

Введите логин и зарегистрируйтесь на список