0
Доступные анализы
Бактериальная культура
- Изоляция живого организма
- Типы образцов: фекалии, содержимое желудка
- Преимущества
-
- Бактерии легко размножаются в течение 1 дня
- Легко провести анализ в любой лаборатории (включая дома).
- Относительно низкие затраты.
- Недостатки:
- Некоторые E. coli являются частью нормальной флоры кишечника.
- У свиней одновременно присутствуют множество E. coli
- У свиней, пролеченных антибиотиками, может предотвращаться размножение бактерий
Чувствительность к антибиотикам
- Тесты in vitro на способность живого организма размножаться при определенных концентрациях различных противомикробных препаратов.
- Типы образцов: фекалии, содержимое желудка
- Преимущества:
- Идентификация чувствительности или резистентности определенных изолятов к распространенным антибактериальным препаратам
- Идентификация трендов противомикробной резистентности.
- Недостатки:
- Требуется бактериальный изолят.
- Тесты in vitro могут слегка отличаться от результатов in vivo.
- Определенные противомикробные препараты могут не тестироваться или требуют отдельного специального тестирования.
- Средние затраты.
Гистопатология
- Оценивает наличие поражения ткани (повреждение), которое может подтвердить наличие заболевания. Иногда также может выявить непосредственное наличие организма (бактерии и паразиты) или опосредованное (вирус) посредствам дополнительного специального окрашивания.
- Типы образцов: ткань.
- Преимущества:
- Связывает бактериальную адгезию с повреждением кишечника
- Отсутствует необходимость специального окрашивания.
- Недостатки:
- Необходимо погрузить ткань кишечника умершей свиньи в формалин в течение 15 минут с момента смерти – ткани кишечника быстро разлагаются.
- Заболеванию могут подвергаться различные сегменты, поэтому требуются различные образцы кишечника.
Генотипирование
- Цепная полимеразная реакция (ПЦР) выявляет наличие определенной последовательности нуклеиновых кислот (ДНК), связанных и известными генами вирулентности.
- Преимущества:
- Проводится с помощью ПЦР, легко в исполнении.
- Помогает идентифицировать патогенность путем выявления наличия генов (не обязательно экспрессии генов), связанной с вирулентными факторами.
-
- Токсичные гены: EAST1, LT, STa, STb, Stx1, Stx2, Stx2e.
- Пилусные гены: F18, F41, K88 (F4), K99 (F5), 987P (F6).
- Адгезивные гены: AIDA, EAEA, PAA.
- Помогает для правильного выбора вакцины (подбор правильных пилей)
Гены E. coli, выявленные по средством ПЦР генотипирования и их функции.
| Ген | Тип | Описание |
|---|---|---|
| EAST1 | Токсин | Кишечный токсин, связывается с тем же рецептором и стимулирует тот же секреторный путь, что и Sta (причина диареи точно не установлена) |
| LT | Токсин | Кишечный токсин,который стимулирует кишечную секрецию |
| STa | Токсин | Кишечный токсин,который стимулирует кишечную секрецию в основном у молодых свиней (снижает абсорбцию воды и электролитов) |
| STb | Токсин | Кишечный токсин,который стимулирует секреторную диарею в основном у взрослых свиней (увеличивает секрецию энтероцитов) |
| Stx1 | Токсин | Кишечный токсин, может быть обнаружен в патогенных и непатогенных штаммах. |
| Stx2 | Токсин | Кишечный токсин, может быть обнаружен в патогенных и непатогенных штаммах. |
| Stx2e | Токсин | Системный токсин, вызывающий повреждение сосудов и отек |
| F18 (F107) | Адгезин | Пили (фимбрии), используются для прикрепления, появляется после 20-дневного возраста и обычно связывается с поносом после отъема или отеком |
| F41 | Адгезин | Пили (фимбрии), используются для прикрепления в основном у неонатальных поросят |
| K88 (F4) | Адгезин | Пили (фимбрии), используются для прикрепления в основном у свиней всех возрастов |
| K99 (F5) | Адгезин | Пили (фимбрии), используются для прикрепления в основном у неонатальных поросят |
| 987P (F6) | Адгезин | Пили (фимбрии), используются для прикрепления в основном у неонатальных поросят |
| AIDA | Адгезин | Нефимбриальный "адгезин, вовлеченный в диффузную дгзию", обычно встречается в сочетании с F18 |
| EAE | Адгезин | Нефимбриальный адгезин, принимающий участие в поражениях, связанных с "прикреплние и поражение" |
| PAA | Адгезин | Нефимбриальный адгезин, принимающий участие в поражениях, связанных с "прикреплние и поражение" |
- Недостатки:
- Требуется бактериальный изолят.
- Надейтесь, что генотипизирован правильный изолят (у свиней может быть одновременно несколько изолятов).
- Средняя цена, но обычно тестируется только один
изолят.
Интерпретация результатов
Бактериальная культура
- Интерпретация гемолиза зависит от возраста свиней:
- До отъема: негемолитический E. coli.
- После отъема: гемолитический E. coli.
- Чистота:
- Чистая культура: наводит на мысль об источнике болезни.
- Смешанная культура: ценность под вопросом
- Количество:
- Большое: наводит на мысль об источнике болезни
- Среднее: различная интерпретация.
- Малое: ценность под вопросом (может быть заражение)
- Отсутствие: Возможно, животное лечили антибиотиками или заражение незначительное.
Негемолитический E coli (слева) и гемолитический E coli (справа).
Чувствительность к антибиотикам
- Чувствительные: возможен большой выбор для лечения, если противомикробный препарат достигает таргет-мишени.
- Устойчивые: выбирайте различные препараты
- МПК: если МПК установлены, убедитесь, что выбранный препарат достигает таргет-органа.
Гистопатология
- Положительная: если наблюдается поражение кишечника с прилипшей к эпителиальным клеткам E. coli
- Отрицательная: Повреждения кишечника отсутствуют
Генотипирование
- Генотипирование очень ценный инструмент если изолят E. coli содержит какой-либо вирулентный фактор, подтверждающий патогенность изолята.
Сценарий
Свиньи с поносом (любой возраст)
- Соберите ректальные мазки от двух или более свиней с поносом, но не проходящих лечение и проверьте на бактериальную культуру, противомикробную резистентность, проведите генотипирование.
- Умертвите 1-3 поросенка с поносом (не проходящих лечение). Незамедлительно отберите и поместите в формалин 3 образца кишечника от каждого поросенка. Соберите свежие образцы кишечника для дальнейшего анализа на бактериальную культуру, противомикробную резистентность и генотипирование.
